六妙门者，盖是内行之根本，三乘得道之要经。故释迦初诣道树，跏跌坐草，内思安般，一数，二随，三止，四观，五还，六净。因此万行开发，降魔成道。当知佛为物轨，亦迹若斯。三乘正士，岂不同游此路？
所言六者，即是数法。约数明禅，故言六也。如佛或约一数辩禅，所谓一行三昧。成约二数，谓一止二双。或约三数，谓三三昧。或约四数，所谓四禅。或约五数，谓五门禅。或约六数，谓六妙门。或约七数，谓七依定。或约八数，谓八背会。或约九数，谓九次第定。或约十数，谓十禅支，如是等，乃至百千万亿阿僧只不可说诸三昧门，悉是约数说诸禅也。虽数有多少，穷其法相，莫不悉相收摄。以众生极语不同，故有增减之数，分别利物。
今言六者，即是约数法而标章也。妙者，其意乃多，若论正意，即是灭谛涅槃。故灭四行中，言灭止妙离。涅槃非断非常，有而难契，无而易得，故言妙也。六法能通，故名为门。门虽有六，会妙不殊。故经言“泥洹真法定”。众生从种种门人，此则通释六妙门之大意也。
六妙门大意有十。
第一历别对诸禅六妙门，第二次第相生六沙门，第三随便宜六妙门，第四随对治六妙门，第五相摄六妙门，第六通别六妙门，第七旋转大妙门，第八观心六妙门，第九圆观六妙门，第十证相六妙门。
释第一历别对诸禅定明六妙门，即为大意。
一者，依数为妙门。行者因数息故，即能出生四禅，四无量心，四无色定。若于最后非非想定，能觉知非是涅槃，是人必定得三乘道。何以故？此定阴界人和合故有虚诳不实．虽无粗烦恼，而亦成就十种细烦恼。知已破折，不住不著，心得解脱，即证三乘涅槃。故此义如须跋陀罗，佛教断非非想处惑，即便获得阿罗汉果，数为妙门，意在于此也。
二者，随为妙门者。行者因随息故，即能出生十六特胜。所谓一知息人，二知息出，三知息长短，四知息偏身，五除诸身行，六心受喜，七心受乐，八受诸心行，九心作喜，十心作摄，十一心作解脱，十二观无常，十三观出散，十四观离欲，十五观灭，十六观弃舍。云何现弃舍？此观破非想处惑。所以者何？凡夫修非想时，观有常处如痈如疮，现无想处如痴也。第一妙走，名曰非想。作是念已，即奔舍有想，无想，名非有想，非无想，故知非想即是两舍之义。今佛弟子观行破折，义如前说。是故深观弃舍，不著非想，能得涅槃，随为妙门，意在此也。
三者，止为妙门者。行者因止心故，即便次第发五轮禅：一者，地轮三昧，即未到地。二者，水轮三昧，即是种种诸禅定善根发也。三者，虚空轮三昧，即五方便人，觉因缘无性如虚空。四者，金沙轮三昧，即是见思解脱，无著正慧，如金沙也。五者，金刚轮三昧，即是第九无碍道能断三界结使，汞尽无余，证尽智无生智人涅槃。止为妙门，意在此也。
四者，观为妙门者。行者因修现故，即能出生九想，八念，十想，八背舍，八胜处，十一切处，九次第定，狮子奋迅三昧，超越三昧，炼禅，十四变化心，三明，六通及八解脱，得灭受想，即人涅槃。观为妙门，意在此也。
五者，还为妙门者。行者若用慧行，善巧被折、反本还源，是时即便出生空无想无作、三十七品，四谛，十二因缘，中道正观，因此得入涅槃。还为妙门，意在此也。
六者，净为妙门者。行者若能体识一切诸法本性清净，即便获得自性禅也。得此禅故，二乘之八，定证涅槃。若是菩萨，入铁轮位，具十信心。修行不止，即便出生九种大禅，所谓自性禅、一切禅、难弹、一切门禅、善人禅、一切行禅、除恼禅、此世他世乐禅、清净禅、菩萨依是禅故，得大菩提果，已得今得当得。净为妙门，意在此也。
次释第二次第相生六妙门者。次第相生，入道之阶梯也。若于欲界中，巧行六法，第六净心成就，即发三乘无漏，况复具足诸禅三昧？此即与前有异。所以者何？
如数有两种．一者修数，二者证数。修数者，行者调和气息，不涩不滑，安详徐数，从一至十，摄心在数，不令驰散，是名修数。证数者，觉心任运，从一至十，不加功力，心住息缘，觉息虚微，心相渐细，患数为粗，意不欲数。尔时行者应当放救修随。
随亦有二：一者修随，二者证随。
修随者，舍前数法，一心依随息之出入，摄心缘息，知息入出，心住息缘，无分散意，是名修随。
证随者，心既微细，安静不乱，觉息长短，偏身入出。心息任运相依，意虑恬然凝静，觉随为粗，心厌欲舍。如人疲极欲眠，不乐众务，尔时行者应当舍随修止。
止亦有二：一者，修止。二者，证止。
修止者，息诸缘虑，不念数随，凝寂其心，是名修止。
证止者，觉身心泯然入定，不见内外相貌，定法持心，任运不动。
行者是时即作是念：今此三昧，虽复无为寂静，安隐快乐，而无慧方便，不能破坏生死。复作是念：今此定者，皆属因缘，阴界入法，和合而有，虚诳不实。我今不见不觉，应须照了。作是念已，即不著止，起观分别。
