无产阶级文化大革命的十年浩劫，把气功作为一种“封、资、修”的文化遭到摧残、破坏。搞气功的人员遭到批斗、游街示众、遣返农村、判刑改造等。1979年，气功得到平反，1980年11月，河北省北戴河气功疗养院也落实政策，挂牌对外开放，接收全国和国际病人来院用气功治疗。但是，此时的气功发展势头又太快了，宣传导向、记者炒作，使气功发展偏离了科学轨道，因而造成了以后极度混乱的局面，给气功事业的发展带来阻力甚至灾难。
我在讲课时，习惯地把建国后的气功发展分为两个高潮、三个阶段：过去的中央领导同志，对医疗气功是非常关心与支持，有的题词、写文章、批条子，如：刘少奇、林伯渠、谢觉哉、董必武、李富春、李先念、彭真、蔡畅、李德全、李书城、王任重、谷牧、叶季壮、朱德、彭德怀、陈毅、刘伯承、叶剑英、贺龙、徐向前、聂荣臻、罗荣桓、林彪（10个元帅）、……林铁、刘子厚、李德、裴仰山、徐运北、程玉林、王光美、邓垦、丁华、段慧轩、杨成武、杨勇、；还有一些知名人士如：宋庆龄、何香凝、蔡挺锴、方石珊、王光美、沙可夫院长（中央戏剧学院）、任诗吟、曹建培、郭兰英、张瑞芳……。还有一些在此不一一列出了。
中国气功发展第一个高潮是1955年--1965年；
第二个高潮是1979年--1989年；
三个发展阶段主要指“文革”后的第二个高潮：
第一个阶段是1979年--1988年恢复发展期；
第二个阶段是发展、管理期1989年--1994年；
第三个阶段是混乱期（无政府状态）1995年--1999年。
在第二个气功发展高潮中有以下几个标志：
1、浙江莫干山中医会议召开并提出气功问题,吕炳奎局长主持会议；
2、1979年中央领导人接见气功汇报团并观看气功表演（误导开始）；
3、1980年11月7日（8日向全国报道）北戴河气功疗养院落实政策恢复名称，恢复全国医疗气功师资班并招生；
4、1981年，中国中医气功科学研究会成立，吕炳奎局长任会长(在保定)；
5、1983年，1984年承办全国医疗气功师资班成功；
6、1986年，中国气功科学研究会成立，国防科工委张震寰将军任理事长，李之楠、肖松任学会秘书长（在北京）；
7、1988年，世界医学气功学会在北京成立卫生部崔月犁部长任会长；
8、《中国医学百科全书·气功卷》编写出版，钱信忠部长任《医学百科全书》大主编，林雅谷为《气功分卷》主编，我和马济人、王卜雄、王若水、刘贵珍、柴宏寿等任编委，张文江、沈再文任编委秘书；
9、《气功》、《气功与科学》、《中华气功》、《中国气功》、《东方气功》、《气功与体育》等杂志公开出版（90年代中国气功科学研究会又出版了《中国气功科学》杂志）；此外有几个生还办了内部出版发行的气功杂志，如：贵州的《气功杂志》、湖南的《大众气功》、湖北的《气功天地》、辽宁的《气功纵横》……
10、1986年中国人体科学研究会在北京成立，张震寰将军任理事长，钱学森教授任名誉理事长，在成立大会上钱学森、赵朴初等名人做了大会发言；
11、上海气功科学研究所建立（未能恢复气功疗养所名称和床位）；
12、气功医疗、健身书籍大量出版，气功古代经典文献大量重印；
13、从事气功科学研究的单位越来越多，特别是中国科学院的一些科研工作者也加入了气功科研队伍，科研成果和发表科研论文也越来越多。
二、医疗气功衰退的社会文化背景这个事业却毁在李洪志邪教的骗子们手中。
这次气功事业受到的挫折和深度，超过无产阶级文化大革命运动那次劫难。即便中央表态支持医疗气功，再次振兴至少也要五年以后（甚至五十年以后）了。我也在研究中国社会气功的气功宗教现象，我初步认为有几个原因：
1、商品社会中人们为了钱，一些骗子钻到气功界兴风作浪；
2、各大、小报记者和医托们，铺天盖地的新闻炒作误导；
3、有一些人发生信仰危机，把气功当做宗教信仰；
4、别有用心的人如李洪志之流巧妙的利用了气功，组织邪教害国害民毁坏了气功声誉；
5、国家管理滞后（卫生部想管管不了体育气功；体委管不了医疗气功；中国气功科学研究会“跨行业管理”）；
